Taman Nasional Sebangau menjadi benteng terakhir bagi berbagai satwa langka yang terancam punah dan mendapat perlindungan hukum tingkat nasional maupun internasional. Orangutan Kalimantan subspesies Pongo pygmaeus wurmbii menjadi prioritas utama konservasi dengan populasi terkini mencapai lebih dari 8.900 individu yang merupakan metapopulasi terbesar di kawasan konservasi Indonesia. Bekantan yang merupakan primata endemik Kalimantan dengan ciri khas hidung panjang juga mendapat perlindungan ketat mengingat statusnya yang terancam kepunahan akibat hilangnya habitat. Beruang madu, spesies beruang terkecil di dunia yang menjadi satu-satunya beruang di Indonesia, mendiami hutan dataran rendah Sebangau dan dilindungi karena populasinya yang terus menurun akibat perburuan dan konflik dengan manusia. Owa Kalimantan yang dikenal dengan suara lengkingannya yang khas, burung rangkong dengan paruh besar yang berperan penting dalam penyebaran benih, serta macan dahan yang merupakan predator puncak di ekosistem gambut, semuanya masuk dalam daftar satwa yang harus dilindungi. Perlindungan terhadap satwa-satwa ini tidak hanya penting untuk menjaga keseimbangan ekosistem, tetapi juga mempertahankan warisan keanekaragaman hayati Indonesia yang menjadi bagian dari tanggung jawab global pelestarian spesies di bumi.